chown рекурсивно

Для смены chown только у директорий, начиная с директории, где Вы находитесь (т.е., в отличие от chown -R, Вам нужно зайти в директорию, начиная с которой нужно менять владельца):
find . -type d -exec chown bitrix:bitrix {} \;

Для смены прав у только файлов:
find . -type f -exec chown bitrix:bitrix {} \;

Где вместо aaa:bbb ставим, соответственно, нужного пользователя и группу.
Статьи схожей тематики: